Rekombinationsfrequenz
Rekombinationsfrequenz zwischen zwei Genloci als Kartierungseinheit in Centimorgan: RF = Nrek / Nges · 100.
Rekombinationsfrequenz berechnen
Rekombinationsfrequenz zwischen zwei Genloci als Kartierungseinheit in Centimorgan: RF = Nrek / Nges · 100.
- RF — Rekombinationsfrequenz
- Nrek — Rekombinante Nachkommen
- Nges — Gesamtnachkommen
Worum geht es?
Die Rekombinationsfrequenz RF beziffert den Anteil rekombinanter Nachkommen aus einer Testkreuzung gekoppelter Genloci. Sie dient als Maß für den genetischen Abstand: 1 % rekombinante Nachkommen entsprechen genau 1 Centimorgan (cM).
Werte nahe 0 sprechen für enge Kopplung, Werte nahe 50 % für freie Rekombination (Loci entweder auf verschiedenen Chromosomen oder weit auseinander).
Die Formel
RF = Nrek / Nges · 100
Umstellungen:
Nrek = RF / 100 · Nges
Nges = Nrek · 100 / RFDie Variablen
| Symbol | Bedeutung | Einheit | Erklärung |
|---|---|---|---|
| RF | Rekombinationsfrequenz | cM | Genetischer Abstand in Centimorgan. |
| Nrek | Rekombinante Nachkommen | — | Anzahl rekombinanter Phänotypen. |
| Nges | Gesamtnachkommen | — | Gesamtanzahl der Testkreuzungs-F1. |
Minimal-Beispiel
In einer Testkreuzung tragen 24 von 200 Nachkommen rekombinante Phänotypen:
RF = 24 / 200 · 100
= 12 cMPraxis-Beispiele
Beispiel 1 — Drosophila-Kartierung
500 Nachkommen einer Testkreuzung, davon 40 rekombinant:
RF = 40 / 500 · 100 = 8 cMBeispiel 2 — Erwartete Rekombinanten
Bei RF = 15 cM und 600 Nachkommen erwartet man:
Nrek = 15 / 100 · 600
= 90Beispiel 3 — Lockere Kopplung
72 Rekombinante in 200 Nachkommen — die Loci liegen nahe an freier Rekombination:
RF = 72 / 200 · 100 = 36 cM